顾晋、陈河兵/伯晓晨团队最新研究成果在Nature Communications发表
发布时间：2024-05-27 16:01:40
来源：
作者：党委办公室
责任编辑：
浏览次数：
近日，北京大学首钢医院院长顾晋教授团队联合军事科学院军事医学研究院陈河兵/伯晓晨研究员团队，共同合作发表的医工结合类研究成果在国际知名期刊Nature Communications发表。
文章第一作者是北京大学肿瘤医院徐婧瑄博士、军事科学院军事医学研究院许翔博士和北京大学首钢医院主治医师黄丹丹博士。染色质拓扑相关结构域（TAD）与肿瘤的发生发展密切相关，研究团队通过开发层级结构相似性算法指标HierSSIM（Hierarchy structural similarity），对13种TAD层级识别算法进行综合性评测，并为研究者在不同条件下提供操作指南。此外，利用准确识别的TAD层级和分析结果，研究团队提出新的TAD层级结构调控模型，深化了对TAD层级结构形成和维持机制的理解。该项研究的创新之处在于首次系统地评估层级TAD检测算法，为生命科学和医学领域对 TAD层级结构感兴趣的研究人员提供了使用指南，推动了未来TAD层级结构在生命活动过程和疾病发生发展中的研究。本篇论文中，研究者通过用计算机模拟细胞混合实验得到阴性的差异，同时用单细胞Hi-C数据验证，从而提示层级TAD在单细胞层面存在的合理性与可能性。这将研究视角聚焦到利用单细胞Hi-C数据检测层级TAD的算法开发和技术突破，给三维基因组领域提示了下一步的研究方向。
京公网安备11010702002740